法律分析：公司要有确切的证据，来证实遗失是由公司员工造成的，那就应当由员工赔偿。
法律依据：《中华人民共和国管理办法》 第三十六条 违反管理法规的行为包括
(一) 未按照规定印制或者生产防伪专用品的
(二) 未按照规定领购的
(三) 未按照规定开具的
(四) 未按照规定取得的
(五) 未按照规定保管的
(六) 未按照规定接受税务机关检查的。
对有前款所列行为之一的单位和个人 由税务机关责令限期改正没收非法所得可以并处1万元以下的罚款。有前款所列两种或者两种以上行为的可以分别处罚。
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